नंबर 2025 से अगस्त 2026 के बीच भारत के तीन चुनाव आयुक्तों में से दो ने आयोग के फैसलों पर 14 बार लिखित आपत्तियां दर्ज कराई हैं। द इंडियन एक्सप्रेस की एक रिपोर्ट के अनुसार, चुनाव आयुक्त सुखबीर सिंह संधू और विवेक जोशी ने कई आदेशों को अनधिकृत बताया है। यह आंतरिक विवाद देशव्यापी विशेष गहन पुनरीक्षण प्रक्रिया को प्रभावित कर रहा है, जिसे आयोग ने सर्वसम्मति से हुआ बताया है।
वैधानिक प्राधिकरण और डेटाबेस पहुंच को लेकर भी विवाद सामने आया है। मई 2026 में, आयुक्त जोशी ने चेतावनी दी थी कि नियमों में संशोधन किए बिना फॉर्म 6 में बदलाव नहीं किया जा सकता। जुलाई 2026 में फॉर्म में बदलाव किया गया, जिसे आयुक्त संधू ने अनधिकृत बताया।
आयुक्त संधू ने अगस्त 2026 में यह भी नोट किया कि राज्य अधिकारियों के पास सिस्टम तक पूरी पहुंच नहीं थी। गोवा में एक परिचालन विफलता भी सामने आई जहां केंद्रीय सॉफ्टवेयर में बहाली प्रक्रिया का विकल्प नहीं होने के कारण पात्र नाम सूची से बाहर रहे।
सुप्रीम कोर्ट ने 22 सितंबर 2026 को दिल्ली में जारी नोटिसों की संख्या को लेकर हस्तक्षेप किया। मुख्य न्यायाधीश सूर्यकांत की अध्यक्षता वाली पीठ ने कहा कि नोटिस मशीनी रूप से जारी किए गए प्रतीत होते हैं।
दिल्ली के मुख्य निर्वाचन अधिकारी के आंकड़ों के अनुसार 33 लाख से अधिक मतदाताओं को नोटिस मिले और लगभग 47 लाख नाम हटाए गए। विपक्षी नेताओं ने इस पर तीखी प्रतिक्रिया दी है, जबकि पूर्व मुख्य निर्वाचन आयुक्त ओ.पी. रावत ने कहा है कि आंतरिक मतभेद बहुत गंभीर हैं। दिल्ली में नोटिसों का निपटारा 29 अक्टूबर 2026 तक पूरा होना है और अंतिम मतदाता सूची 4 नवंबर 2026 को आने की उम्मीद है।
